Bowser Jr. é o único filho de Bowser, herdeiro do Rei Koopa ao trono e o antagonista secundário da série Mario. Bowser Jr. apareceu pela primeira vez em Super Mario Sunshine e ajudou Bowser a sequestrar a Princesa Peach e lutar contra Mario e Luigi em muitos jogos subsequentes. Bowser Jr. não quer nada mais do que fazer a vontade maligna de seu pai e o lado emocional raramente visto de Bowser é frequentemente trazido à tona por suas interações com seu filho. Bowser Jr. pode ser resumido como um ousado e enérgico encrenqueiro. Seu problema em fazer lado é visto como ele engana Mario tanto em Super Mario Sunshine e New Super Mario Bros. De acordo com Mario Kart Wii, Bowser Jr. herdou a má atitude de seu pai, evidente em seu lema (\"Sorria e aguente isso. Quando isso não funcionar, sorria e esmague.\"). Ele também é molenga, mimado e mal-humorado, embora em Mario Party DS é afirmado que ele tem um lado solitário. Seus hobbies favoritos são roubar biscoitos, causar problemas para as pessoas e rabiscar (o que pode explicar o grafite generalizado que foi feito na Ilha Delfino). No entanto, ele parece determinado a derrotar Mario em uma luta justa, a fim de provar seu poder. Sua biografia em Paper Mario: Sticker Star sugere que ele também é ocasionalmente preguiçoso devido a montar seu Koopa Clown Car durante todo o jogo.